Zellsorter & Zellanalytik|PD Dr. Petra Hoffmann

Die 'Central FACS Facility' (CFF) des RCI bietet Arbeitsgruppen des Universitätsklinikums und der Universität die Möglichkeit, einzelne Zellpopulationen gezielt zu isolieren und so für weitere Analyseprozesse zugänglich zu machen. Darüber hinaus bieten wir mit unserem Fachwissen Einsteigern und Fortgeschrittenen beratende Unterstützung bei durchflusszytometrischen Fragestellungen und Problemen, wie z.B. der Wahl des geeigneten Fluorochroms, dem Erstellen eines Färbepanels für die Vielfarbenanalyse oder der Optimierung von Gating Strategien.   

Die CFF ist mit einem BD FACSAriaTM IIu Highspeed Zellsorter ausgestattet, der auf Operator Basis betrieben wird. Desweiteren steht ein BD FACSCaliburTM Analysegerät (2 Laser, 4 Farben) zur Verfügung.

Es können maximal 9 verschiedene Fluorochrome (+ FSc/SSc) gleichzeitig bestimmt und bis zu vier verschiedene Populationen simultan aus einer Probe isoliert werden. Die maximale Sortgeschwindigkeit beträgt 70.000 Events/sec. Desweiteren bietet die CFF die Möglichkeit der Sortierung und Zellablage (auch von Einzelzellen) in verschiedene Mikrotiterplattenformate.

Der Zellsorter steht in einem S1 Bereich, weshalb nur Proben bis zur Sicherheitsstufe S1 (Gentechnik und Bio Gefahrenstoffe) angenommen werden können. Nach jedem Sort erfolgt eine Reanalyse der isolierten Population am Gerät sowie der Ausdruck eines Sortreports. Alle FCS Files eines Sorts werden in der CFF gespeichert und in Kopie den Nutzern zur Verfügung gestellt.

Alle weiteren Details, Kontaktdaten und Hinweise für Erstnutzer

User guide

New Users

  • To schedule your sort appointments call 944-5549 ( R. Eder or I. Fink) at least ONE WEEK prior to intended sort date
  • Appointments can be booked Monday to Friday between 8 am and 4 pm (other times upon request)
  • If possible provide a flow cytometric analysis of the intended sort material (or one as similar as possible) prior to the first sort date
  • Fill out the FACS Questionnaire (see 'Useful Links') and bring it with you on the sort day (do not forget to provide a signature from your PI)
  • If you are late for your appointment please give us a call (lab: 944-5549 or at the sorter: 944-6644). Delay may result in reduced time for sorting
  • Please provide a telephone number for contact on the sort day 

Cell Sorting - Sample Requirements

  • Ideal cell concentration for most sorting material: 20 x 10e6 cells/ml
  • Minimum sample volume: 0,5 ml
  • Sorting material must be prepared and kept under sterile conditions (exceptions only upon prior request)
  • Cells must be resuspended in sterile PBS (addition of serum/protein possible; please consult operators) and filtered immediately before sorting  (≤ 40µm)
  • PLEASE NOTE: Safety level S1 material (genetic engineering and biohazard) can be sorted without prior notice. Upon special request and ONLY AFTER PRIOR CONSULTATION we might be able to sort material with biohazard level S2.

Data Management

  • all data acquired during sorting is automatically saved on a local hard drive
  • a safety copy will periodically be made on an external hard drive
  • all users are recommended to store their personal data additionally on their own device

Useful Links

Information

Instruments & Locations

FACS Aria IIu

  • high speed sorting(max 70.000 events/s)
  • 3 laser / max 9 different colours & FSc/SSc
  • one- to four-way bulk sorting devices for a variety of tube sizes (50 ml,15 ml,5 ml; Microtubes)
  • BD™ Automated Cell Deposition Unit (ACDU) for sorting to Multiwell plates (24-, 48-, 96-well plates; bulk or single cell deposit)

Location
Institute of Immunology
Building D3 /1st  Floor
Room 4.35
Phone: 944-5482


FACS Calibur / FACS Calibur 2

  • 2 laser / max. 4 different colours & FSc/SSc 
  • Data acquisition via CellQuest Pro

Location FACS Calibur
Building D3 /Ground Floor
Room 3.39

Location FACS Calibur 2
Institute of Immunology
Building D3 /1st  Floor
Room 4.50

 


LSR

  • 4 laser/ max. 13 different colours & FSc/SSc
  • Data acquisition via FACS Diva Software

Location
Institute of Immunology
Building D3 /1st  Floor
Room 4.37 

Facility Staff

PD Dr. Petra Hoffmann
Head
Phone: 944-5592
Fax: 944-5593
petra.hoffmann(at)ukr.de

Rüdiger Eder
Chief Operator
Phone: 944-5549
ruediger.eder(at)ukr.de

Jaqueline Igl
Operator
Phone: 944-5145
jaqueline.igl@ukr.de

Irina Fink
Operator
Phone: 944-5549
irina.fink(at)ukr.de

Dr. Michael Delacher
Person responsible for LSR + Calibur 2
Phone: 944-5464
michael.delacher@ukr.de 

Important Contact Information

To schedule an appointment:

  • Rüdiger Eder                 phone: 944-5549
  • Irina Fink                       phone: 944-5549
  • Jaqueline Igl                  phone: 944-5145
  • Dr. Michael Delacher  phone:944-5464
    (LSR and Calibur 2) 

To reach operators during sorting

  • Aria                                  phone: 944-5482

For consulting on

  • sample preparation
  • multicolour panels (composition/gating/analysis)
  • FACS-based assay systems:

Petra Hoffmann                        phone: 944-5592

News

The CFF has now moved to the Institute of Immunology, Building D3 / 1st Floor!

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